Restriktionsenzyme arbeiten nach einem einfachen Prinzip: Sie schneiden DNA an ganz bestimmten Sequenzen in zwei Teile. Diese Sequenzen sind typischerweise Palindrome (Ein Palindrom liest sich vorwärts wie rückwärts gleich. Also zum Beispiel GAATTC, dessen Tochterstrang CTTAAG wäre).
Die Enzyme schneiden in zwei Varianten:
Die Funktion von Restriktionsenzymen sollte jedem geläufig sein, da sie als Definition abgefragt werden kann.